无菌实验室主要控制有生命微粒(细菌)与无生命微粒(尘埃)对工作对象的污染。可分为：一般生物实验室和生物安全实验室。
1、 一般生物实验室，主要控制微生物(细菌)对象的污染。无菌室装修其内部材料要能经受各种灭菌剂侵蚀，内部一般保证正压。实质上其内部材料要能经受各种灭菌处理的工业洁净室。例：制药、食品、化妆品、饮料产品等工业实验室、医院实验室、微生物实验室、动物实验室、理化检验室、血站等。
2、 生物安全实验室：主要控制工作对象的有生命微粒对外界和人的污染。内部要保持与大气的负压。例：细菌学、生物学、物物工程(重组基因、疫苗制备)等。
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